Ionia 2000 ist ein Fußballverein aus der Stadt Ioannina in Griechenland. Er wurde im Jahr 2000 gegründet und spielt in der dritthöchsten griechischen Liga, der Gamma Ethniki. Die Vereinsfarben sind Rot und Blau.
Der Verein wurde von einer Gruppe junger Fußballspieler aus Ioannina gegründet, die sich zum Ziel gesetzt hatten, einen erfolgreichen Fußballverein in ihrer Stadt zu gründen. In den ersten Jahren spielte der Verein in den unteren Ligen Griechenlands, konnte sich aber schnell in die dritthöchste Liga hocharbeiten.
In der Saison 2010/11 wurde Ionia 2000 Meister der Gamma Ethniki und stieg in die Beta Ethniki auf. In der zweithöchsten griechischen Liga konnte sich der Verein jedoch nicht halten und musste nach einer Saison wieder in die Gamma Ethniki absteigen.
In den folgenden Jahren spielte Ionia 2000 in der Gamma Ethniki, konnte aber nie wieder an den Erfolg der Saison 2010/11 anknüpfen. Im Jahr 2017 wurde der Verein wegen finanzieller Probleme aufgelöst.
Im Jahr 2020 wurde Ionia 2000 neu gegründet und spielt seitdem wieder in der Gamma Ethniki. Der Verein hat sich zum Ziel gesetzt, wieder in die Beta Ethniki aufzusteigen und sich langfristig in der zweithöchsten griechischen Liga zu etablieren.
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