Schweiz - Challenge League | 11/23 18:00 | 15 | [9] FC Schaffhausen v FC Vaduz [7] | L | 0-3 | |
Schweiz - Challenge League | 11/10 14:00 | 14 | [1] Lausanne Sports v FC Schaffhausen [8] | L | 5-0 | |
Schweiz - Challenge League | 11/02 16:00 | 13 | [9] FC Schaffhausen v Winterthur [4] | D | 1-1 | |
Schweiz - Challenge League | 10/26 15:30 | 12 | [5] Kriens v FC Schaffhausen [9] | D | 2-2 | |
Schweiz - Challenge League | 10/19 17:00 | 11 | [9] FC Schaffhausen v Grasshoppers Zürich [2] | D | 1-1 | |
Schweiz - Challenge League | 10/05 15:00 | 10 | [10] FC Chiasso v FC Schaffhausen [9] | W | 0-1 | |
Schweiz - Challenge League | 09/27 18:00 | 9 | [7] Winterthur v FC Schaffhausen [8] | L | 3-1 | |
Schweiz - Challenge League | 09/24 18:00 | 8 | [7] FC Schaffhausen v Kriens [6] | L | 0-2 | |
Schweiz - Challenge League | 09/21 17:00 | 7 | [8] Aarau v FC Schaffhausen [5] | L | 3-1 | |
Freundschaftsspiele - Europa | 09/04 10:00 | - | FC Schaffhausen v FC Zürich | D | 1-1 | |
Schweiz - Challenge League | 08/31 17:00 | 6 | [8] FC Schaffhausen v FC Chiasso [10] | W | 1-0 | |
Schweiz - Challenge League | 08/24 17:00 | 5 | [6] FC Schaffhausen v Stade Lausanne-Ouchy [10] | L | 0-1 | |
Schweiz - Pokal | 08/18 12:00 | 6 | FC Linth 04 v FC Schaffhausen | L | 3-1 | |
Schweiz - Challenge League | 08/09 18:00 | 4 | [1] Grasshoppers Zürich v FC Schaffhausen [9] | W | 0-1 | |
Schweiz - Challenge League | 08/03 17:00 | 3 | [8] FC Schaffhausen v Wil 1900 [6] | D | 3-3 | |
Schweiz - Challenge League | 07/28 14:00 | 2 | [9] FC Vaduz v FC Schaffhausen [6] | L | 2-0 | |
Schweiz - Challenge League | 07/20 17:00 | 1 | [5] FC Schaffhausen v Lausanne Sports [5] | D | 2-2 | |
Freundschaftsspiele - Europa | 07/10 17:00 | - | FC Schaffhausen v YF Juventus | W | 2-1 | |
Freundschaftsspiele - Europa | 07/06 14:00 | - | Grasshoppers Zürich v FC Schaffhausen | L | 4-0 | |
Schweiz - Challenge League | 05/26 14:00 | 36 | [4] Winterthur v FC Schaffhausen [7] | L | 3-2 | |
Schweiz - Challenge League | 05/23 18:00 | 35 | [8] FC Schaffhausen v Wil 1900 [5] | W | 2-0 | |
Schweiz - Challenge League | 05/15 18:00 | 34 | [3] Lausanne Sports v FC Schaffhausen [9] | D | 0-0 | |
Schweiz - Challenge League | 05/11 15:30 | 33 | [9] FC Schaffhausen v Aarau [3] | L | 1-2 | |
Schweiz - Challenge League | 05/04 15:30 | 32 | [9] FC Schaffhausen v Servette Genf [1] | L | 0-2 | |
Schweiz - Challenge League | 04/27 16:00 | 31 | [6] FC Vaduz v FC Schaffhausen [8] | W | 0-2 | |
Schweiz - Challenge League | 04/20 15:30 | 30 | [7] Kriens v FC Schaffhausen [9] | W | 1-2 | |
Schweiz - Challenge League | 04/13 15:30 | 29 | [9] FC Schaffhausen v FC Rapperswil-Jona [10] | L | 0-2 | |
Schweiz - Challenge League | 04/06 17:55 | 28 | [8] FC Chiasso v FC Schaffhausen [9] | D | 2-2 | |
Schweiz - Challenge League | 04/02 18:00 | 27 | [8] FC Schaffhausen v Winterthur [4] | L | 1-3 | |
Schweiz - Challenge League | 03/30 18:00 | 26 | [4] Aarau v FC Schaffhausen [8] | L | 3-2 |
Der FC Schaffhausen aus der Stadt Schaffhausen wurde 1896 – an einem Unterhaltungsabend auf dem Munot – als „Football-Club Viktoria“ gegründet und gehört zu den ältesten Schweizer Fussballclubs: Es gibt nur acht heute noch bestehende Vereine, die früher gegründet wurden.
Erster Vereinspräsident war der Schaffhauser Kaufmann Robert Sturzenegger, Bruder des bekannten Kunstmalers Hans. Ab 1902 firmierte der Verein – der lange Jahre um sein Überleben kämpfte – dann unter "Fussball-Klub Schaffhausen", später unter "Vereinigte Fussball-Klubs von Schaffhausen" und zwischen 1915 und 1936 unter "Vereinigte FC Schaffhausen-Sparta", bevor er seinen heutigen Namen erhielt. Während der Verein noch bis in die 1920er Jahre keinen eigenen Platz besass, war er bereits im Frühjahr 1901 in die Schweizerische Fussball-Association aufgenommen worden.
Die Schaffhauser gehörten bisher 54 Saisons der zweithöchsten Spielklasse an und spielten von 1955 bis 1957, 1961/62 und 1963/64 in der Nationalliga A. Nach dem erneuten Aufstieg im Jahre 2004 musste der FC Schaffhausen im Sommer 2007 absteigen und spielt nun in der Challenge League, der zweithöchsten Spielklasse der Schweiz.
Am 21. März 2007 trennte sich der FC Schaffhausen von seinem langjährigen Trainer Jürgen Seeberger. Er war bereits in der 7. Saison beim FC Schaffhausen als Cheftrainer tätig und führte die Mannschaft von der 1. Liga bis in die Axpo Super League. Anschliessend übernahm Marco Schällibaum den Trainerposten und kämpfte mit der Mannschaft gegen den Abstieg in die Challenge League. Dieser konnte allerdings nicht verhindert werden, da man im letzten Spiel mit 0:2 gegen den FC Thun verlor. In der Saison 2010/11 folgte ein weiterer Tiefpunkt in der Vereinsgeschichte des FC Schaffhausen, der FCS verlor in der vorletzten Runde im Spiel gegen Stade Nyonnais mit 2:3 und musste deswegen in die 1. Liga absteigen.
Am 29. April 2013 wurde bekanntgegeben, dass der FC Schaffhausen alle benötigten sechs Kriterien (Recht, Infrastruktur, Sport, Administration, Finanzen und Sicherheit) erfüllt, um sich die Spiellizenz für die Challenge League zu sichern. In der letzten Partie der Saison 12/13 gelang dem FCS der Wiederaufstieg in die Challenge League.
Von 1991 bis zu seinem Tod im Januar 2019 war Aniello Fontana Präsident und Förderer des FC Schaffhausen. Er war treibende Kraft hinter dem Bau des neuen Stadions Lipo-Park, das Anfang Januar 2017 eröffnet wurde und das bisherige Stadion Breite ersetzte.
Von Ende Juni 2019 bis Ende 2023 amtete Roland Klein als Präsident des FC Schaffhausen.
Am 21. Februar 2022 gelang ihm ein echter Transfercoup. Man konnte den ehemaligen Fußball-Bundesliga-Spieler Raul Bobadilla verpflichten.
In der Saison 2021/22 erreichte man den 2. Platz, was zur Teilnahme an der Barrage gegen den 9. der Super League berechtigte. Nach einem 2:2-Unentschieden zuhause verlor man auswärts in Luzern 2:0. Der FC Luzern blieb somit eine weitere Saison in der Super League und der FC Schaffhausen in der Challenge League.
In der Saison 2022 amtete Hakan Yakin, der Bruder des Schweizer Nati-Trainers Murat Yakin, als Trainer.
In der Saison 2023 gelang mit der Verpflichtung von Eren Derdiyok wiederum ein kleinerer Transfercoup.
Ende 2023 wurde Jimmy Berisha Verwaltungsratspräsident des FC Schaffhausen. Im Januar trennte sich Berisha von Hauptsponsor Berformance, dem in der Presse ein "zweifelhaftes Geschäftsmodell mit absurden Gewinnversprechen" vorgeworfen wurde. Neuer Hauptsponsor wurde im Frühjahr 2024 verläufig bis zum Sommer 2024 die Firma Ernaled AG (Rümlang) mit der Absicht der Vertiefung der Zusammenarbeit in den folgenden Monaten.
Mit Jimmy Berisha stiessen die folgenden Personen ebenfalls zum FCS:
Als eine der ersten Amtshandlungen wurde ein Neuer Cheftrainer verpflichtet. Seit Anfang 2024 hat Christian Wimmer diesen Job inne. Ihn assistiert Ervin Gashi.
Nach einer nicht sehr gelungen ersten Saisonhälfte 2023/24 war das neue Team gefordert. So wurden im Winter ganze neun Spieler verpflichtet. Darunter auch gestandene Spieler mit viel Erfahrung. Diese waren:
Ebenso konnte mit Valon Zumberi ein junger Verteidiger aus der 2. Bundesliga ausgeliehen werden. Was als kleiner Transfercoup gezählt werden darf.